csm_centogene-rewolucjonizując-rozwiązania-genetyczne_dlaczego-wybierać-nagłówek_889fbcb66f

Publikacje naukowe

Ciekawi Cię najnowsze odkrycia naukowe?

Niezaspokojone potrzeby w interpretacji wariantów genomu ludzkiego

Jakość i precyzja ostatecznej diagnozy nie zależą wyłącznie od prawidłowej klasyfikacji wariantów i interpretacji klinicznej. Diagnoza rozpoczyna się na poziomie przedanalitycznym, a każda późniejsza interpretacja może przynieść zarówno wynik negatywny, jak i pozytywny.

Jakość i precyzja ostatecznej diagnozy nie zależą wyłącznie od prawidłowej klasyfikacji wariantów i interpretacji klinicznej. Diagnoza rozpoczyna się na poziomie przedanalitycznym, a każda późniejsza interpretacja może przynieść efekt negatywny lub pozytywny, w zależności od jakości preparatu “na mokro”.

Author(s): Bauer, Dr. Peter, MD
Read publication (PDF)

17q23.2q23.3 de Novo Duplikacja

Przedstawiamy przypadek 7,5-letniego chłopca z zaburzeniami mowy i języka, trudnościami w uczeniu się, brakiem koordynacji i stereotypowymi ruchami dłoni. Czytaj więcej!

Rearanżacje chromosomowe obejmujące 17q23 opisywano rzadko. Delecje w 17q23.1q23.2 odnotowano u osób z opóźnieniem rozwoju i zahamowaniem wzrostu, natomiast duplikacje w 17q23.1q23.2 wydają się być związane z deformacją stopy końsko-szpotawej. Przedstawiamy przypadek 7,5-letniego chłopca z zaburzeniami mowy i języka, trudnościami w uczeniu się, zaburzeniami koordynacji, zaburzeniami motoryki małej, sporadycznymi napadami padaczkowymi z nieprawidłowym zapisem EEG oraz zaburzeniami zachowania (łagodne samookaleczenia, nadpobudliwość-nieuwaga i stereotypowe ruchy rąk).

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Wessel, Karen, PhD, Kishore, Shivendra, PhD, Suleimann, Jehan, PhD, Khalaf, Tamam, El-Hattab, Ayman, MD
Read publication (PDF)

Glukozylosfingozyna powoduje zmiany hematologiczne i trzewne u myszy

Stworzyliśmy długoterminowy model infuzji u myszy, aby zbadać wpływ lizo-Gb1 na reprezentatywne parametry charakterystyczne dla choroby Gauchera. Czytaj więcej!

Glukozyloceramid i glukozylosfingozyna to dwa główne produkty magazynowania w chorobie Gauchera (GD), dziedzicznym zaburzeniu metabolicznym spowodowanym niedoborem enzymu lizosomalnego glukocerebrozydazy. Patologiczna rola deacylowanej formy glukozyloceramidu, glukozylosfingozyny (lizo-Gb1), niedawno zidentyfikowanego czułego i swoistego biomarkera GD, nie została dobrze zbadana. Stworzyliśmy model długoterminowej infuzji u myszy C57BL/6JRj, aby zbadać wpływ lizo-Gb1 na reprezentatywne parametry charakterystyczne dla GD.

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Eichler, Sabrina, PhD, Lukas, Jan, PhD, Cozma, Dr. rer. nat. Claudia, MD, Kramp, Guido Johannes, PhD, Kropp, Prof. Peter, MD, Böttcher, Tobias, PhD, Witt, Prof. Martin, MD, Meyer, Anja, Yang, Fan, Neßlauer, Anna-Maria
Read publication (PDF)

Charakterystyka funkcjonalna rzadkich wariantów RAB12

Mutacje w genach RAB są coraz częściej uznawane za przyczynę różnorodnych zaburzeń, w tym schorzeń neurologicznych. Podczas gdy dystonia muzyczna (MD) i dystonia pisarska (WD) to zaburzenia ruchowe specyficzne dla danego zadania, inne dystonie, takie jak dystonia szyjna, uporczywie wpływają na postawę.

Mutacje w genach RAB (należących do rodziny Ras) są coraz częściej uznawane za przyczynę różnorodnych zaburzeń, w tym schorzeń neurologicznych. Podczas gdy dystonia muzyczna (MD) i dystonia pisarska (WD) to zaburzenia ruchowe specyficzne dla danego zadania, inne dystonie, takie jak dystonia szyjna, uporczywie wpływają na postawę.

Author(s): Hebert, Ewa
Read publication (PDF)

Polimorfizmy genu VEGF-A i reakcje na doszklistkowe leczenie ranibizumabem u pacjentów z cukrzycowym obrzękiem plamki

Celem tego badania było zbadanie związku między polimorfizmami genu VEGF a odpowiedzią na leczenie doszklistkowo ranibizumabem u pacjentów z cukrzycowym obrzękiem plamki. Czytaj więcej!

Celem niniejszego badania było zbadanie związku między polimorfizmami genu VEGF a odpowiedzią na leczenie doszklistkowym ranibizumabem (IVR) u pacjentów z cukrzycowym obrzękiem plamki (DME). To prospektywne badanie, przeprowadzone na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Kutahya Dumlupinar, objęło 95 pacjentów z DME leczonych IVR oraz 32 pacjentów bez DME pomimo proliferacyjnej retinopatii cukrzycowej (PDR). Uczestników podzielono na trzy grupy: z DME i nieproliferacyjną retinopatią cukrzycową, z DME i PDR oraz bez DME; pacjentów z DME leczonych IVR podzielono dodatkowo na dwie grupy w zależności od odpowiedzi na leczenie.

Author(s): Yüksel, Zafer, MD, Tetikoğlu, Mehmet, MD, Aktas, Serdar, MD, Sağdik, Haci Murat, Özcura, Fatih
Read publication

Charakterystyka kliniczna i genetyczna sporadycznej ataksji zwyrodnieniowej u dorosłych

Nasze badanie dostarcza danych ilościowych na temat fenotypu klinicznego i progresji ataksji sporadycznej z początkiem w wieku dorosłym. Dowiedz się więcej w tej publikacji!

Celem niniejszego badania jest określenie fenotypu klinicznego i historii naturalnej sporadycznej ataksji zwyrodnieniowej o początku w wieku dorosłym oraz identyfikacja domniemanych mutacji powodujących chorobę. Głównym miernikiem ciężkości choroby była Skala Oceny i Oceny Ataksji (SARA). Próbki DNA przebadano pod kątem mutacji, wykorzystując panel genów specyficznych dla ataksji o wysokim pokryciu w połączeniu z sekwencjonowaniem nowej generacji. Analizę przeprowadzono na 249 uczestnikach. Nasze badanie dostarcza danych ilościowych na temat fenotypu klinicznego i progresji sporadycznej ataksji o początku w wieku dorosłym.

Author(s): Klopstock, prof. Thomas, MD, Bauer, dr Peter, MD, Dudesek, Ales, MD, Sturm, Marc, PhD, Giordano, Ilaria, MD, Harmuth, Florian, Jacobi, Heike, MD, Paap, Brigitte, PhD, Vielhaber, Stefan, MD, Machts, Judith, Schöls, Ludger, MD, Synofzik, Matthis, MD, Tallaksen, Chantal, MD, Wedding, Iselin, MD, Boesch, Sylvia, MD, Eigentler, Andreas, MD, van de Warrenburg, Bart, MD, van Gaalen, Judith, MD, Kamm, Christoph, MD, Kang, Jun-Suk, MD, Timmann, Dagmar, MD, Silvestri, Gabriella, MD, Masciullo, Marcella, MD, Neuhofer, Christiane, MD, Ganos, Christos, MD, Filla, Alessandro, MD, Tezenas du Montcel, Sophie, MD, PhD, Klockgether, Thomas, MD

Patologia serca i układu nerwowego w złożonej heterozygotycznej ataksji Friedreicha

Obserwacje zawarte w tej publikacji potwierdziły wniosek, że upośledzona transkrypcja FXN determinuje fenotyp patologiczny ataksji Friedreicha. Czytaj więcej!

U niewielkiego odsetka pacjentów z ataksją Friedreicha (FA) mutacja patogenna jest heterozygotyczna i składa się z ekspansji powtórzeń trinukleotydu guanina-adenina-adenina (GAA) w jednym allelu oraz delecji, mutacji punktowej lub insercji w drugim. W 2 przypadkach heterozygotycznej ataksji Friedreicha ekspansja GAA została odziedziczona po matce, a delecje po ojcu.

Author(s): Bauer, Dr. Peter, MD, Becker, Alyssa, Qian, Jiang, PhD, Gelman, Benjamin, PhD, MD, Yang, Michele, MD, Koeppen, Arnulf, MD
Read publication (PDF)

Aktywacja PKC wyzwala ratunek komórek glejowych iPSC specyficznych dla pacjentów NPC1 z gliozy

Ponieważ analiza komórek dotkniętych chorobą jest niemożliwa u pacjentów z NPC1, opracowaliśmy model in vitro oparty na komórkach pochodzących z iPSC specyficznych dla pacjentów z NPC1. Czytaj więcej!

Choroba Niemanna-Picka typu C1 (NPC1) to rzadkie, postępujące schorzenie neurodegeneracyjne, spowodowane mutacjami w genie NPC1. Mechanizmy patologiczne leżące u podstaw NPC1 nie są jeszcze w pełni poznane. Szczególnie kontrowersyjny jest udział komórek glejowych i gliozy w progresji NPC1. Ponieważ analiza komórek dotkniętych chorobą jest niemożliwa u pacjentów z NPC1, opracowaliśmy niedawno model in vitro oparty na komórkach pochodzących z iPSC specyficznych dla pacjentów z NPC1.

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Frech, Moritz J, PhD, Peter, Franziska, Rost, Sebastian
Read publication (PDF)

Redukcje glukozylosfingozyny

Choroba Gauchera (GD), autosomalna recesywna choroba spichrzeniowa lipidów, jest wynikiem mutacji w genie GBA1 (β-glukocerebrozydazy), co prowadzi do gromadzenia się glukozyloceramidu w makrofagach tkankowych. Dowiedz się więcej o badaniach klinicznych fazy 3 na naszej stronie internetowej!

Choroba Gauchera (GD), autosomalna recesywna choroba spichrzeniowa lipidów, jest wynikiem mutacji w genie GBA1 (β-glukocerebrozydazy), co prowadzi do gromadzenia się glukozyloceramidu w makrofagach tkankowych. Lizo-Gb1 (glukozylosfingozyna, lizo-GL1), dalszy produkt metabolizmu glukozyloceramidu, został zidentyfikowany jako obiecujący biomarker w diagnostyce i monitorowaniu pacjentów z GD.

Author(s): Eichler, Sabrina, PhD, Elstein, Deborah, Zimran, Ari, MD, Cozma, Dr. rer. nat. Claudia, MD, Böttcher, Tobias, PhD, Mellgard, Björn, PhD MD, Dinh, Quinn, MD, Lan, Lan, Qiu, Yongchang, PhD
Read publication (PDF)

Sondy fluorescencyjne do selektywnego znakowania białek w lizosomach: przypadek α-galaktozydazy A

W badaniu tym wykazano, że sondy fluorescencyjne umożliwiają selektywne znakowanie białek w lizosomach w przypadku α-galaktozydazy A. Przeczytaj więcej w tej publikacji naukowej!

W niniejszym badaniu zaprezentowano sondy fluorescencyjne do selektywnego znakowania białek w lizosomach w przypadku α-galaktozydazy A, co dodatkowo przyczynia się do poszerzenia wiedzy na temat diagnostyki i patologii choroby Fabry'ego. Nowo opracowana technologia obrazowania żywych komórek oparta na fluorescencji, specyficznie znakowanego białka lizosomalnego, z wykorzystaniem ulepszonej sondy biarsenikowej, wykazała, że może ona zostać wykorzystana do identyfikacji nowych związków, które promują prawidłowy transport zmutowanej α-galaktozydazy do przedziałów lizosomalnych i przywracają fenotyp mutacji.

Author(s): Rolfs, Prof. Arndt, MD, Lukas, Jan, PhD, Bohl, Cornelius, Pomorski, Adam, PhD, Seemann, Susanne, Knospe, Anne-Marie, Zheng, Chaonan, Krężel, Artur, PhD
Read publication

C26-Ceramid jako wysoce czuły biomarker w diagnostyce choroby Farbera

Badania wykazały, że ceramid C26:0, a zwłaszcza jego izoforma 1, jest wysoce czułym i swoistym biomarkerem choroby Farbera. Przeczytaj więcej w tej publikacji!

Choroba Farbera (FD) to rzadka, autosomalna recesywna choroba spowodowana mutacjami w genie ceramidazy kwasowej (ASAH1). Niska aktywność ceramidazy powoduje akumulację substancji tłuszczowych, głównie ceramidów. Charakterystycznymi objawami klinicznymi są guzki okołostawowe, lipogranuloma, obrzęk i ból stawów oraz chrypka. Fenotypy FD są heterogeniczne, od łagodnych do bardzo ciężkich przypadków, a pacjenci nie przeżywają pierwszego roku życia. W badaniu tym uczestniczyła największa liczba pacjentów z chorobą Farbera i nosicieli, u których zgłoszono wystąpienie choroby. Badania z wykorzystaniem chromatografii cieczowej z wielokrotną reakcją spektrometrii mas (LC/MRM-MS) wykazały, że ceramid C26:0, a zwłaszcza jego izoforma 1, jest wysoce czułym i swoistym biomarkerem FD (p < 0,0001). Nowy biomarker można oznaczyć bezpośrednio w suszonych ekstraktach z kropli krwi, przy niskim zużyciu próbki. Pozwala to na łatwe przygotowanie próbki, wysoką powtarzalność i wykorzystanie w badaniach przesiewowych o wysokiej przepustowości.

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Brandau, Oliver, MD, Giese, Anne Katrin, MD, Eichler, Sabrina, PhD, Lukas, Jan, PhD, Cozma, Dr. rer. nat. Claudia, MD, Böttcher, Tobias, PhD, Hovakimyan, Marina, PhD, Iurașcu, Marius-Ionuț, Zielke, Susanne
Read publication (PDF)

Zwiększona zdolność regeneracyjna nabłonka węchowego w chorobie Niemanna-Picka typu C1

Przeanalizowaliśmy wpływ neurodegeneracji na nabłonek węchowy myszy NPC1-/- i zaobserwowaliśmy znaczną utratę dojrzałych neuronów receptorów węchowych. Czytaj więcej!

Choroba Niemanna-Picka typu C1 (NPC1) to śmiertelna neurovisceralna lizosomalna choroba spichrzeniowa lipidów. Mutacja białka NPC1 wpływa na homeostazę i transport cholesterolu i glikosfingolipidów z późnych endosomów/lizosomów do siateczki śródplazmatycznej, co prowadzi do postępującej neurodegeneracji. Ponieważ upośledzenie węchu jest jednym z najwcześniejszych objawów wielu chorób neurodegeneracyjnych, skupiliśmy się na zmianach w nabłonku węchowym w mysim modelu NPC1. Na podstawie immunohistochemicznej oceny nabłonka węchowego przeanalizowaliśmy wpływ neurodegeneracji na nabłonek węchowy myszy NPC1-/- i zaobserwowaliśmy znaczną utratę dojrzałych neuronów receptorowych węchowych, a także zwiększoną liczbę komórek proliferujących i apoptotycznych.

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Wree, prof. Andreas, MD, Witt, prof. Martin, MD, Meyer, Anja, Günther, René, Schmitt, prof. Oliver, MD
Read publication (PDF)

Kompleksy biogenezy specyficzne dla receptora AMPA kontrolują transmisję synaptyczną i sprawność intelektualną

W artykule przedstawiono wgląd w wczesną biogenezę receptorów AMPAR i jej wyraźny wpływ na transmisję synaptyczną i funkcjonowanie mózgu. Czytaj więcej!

Receptory glutaminianowe typu AMPA (AMPAR), kluczowe elementy neurotransmisji pobudzającej w mózgu, to kompleksy makromolekularne, których właściwości i funkcje komórkowe są determinowane przez współzłożone składniki ich proteomu. W niniejszym artykule identyfikujemy kompleksy AMPAR, które przejściowo tworzą się w siateczce śródplazmatycznej (ER) i nie posiadają podjednostek rdzeniowych typowych dla AMPAR w błonie komórkowej. Centralnymi składnikami tych AMPAR typu ER są składniki proteomu FRRS1l (C9orf4) i CPT1c, które specyficznie i kooperatywnie wiążą się z białkami GluA1-4 receptorów AMPAR, tworzącymi pory. Nasze wyniki dostarczają wglądu we wczesną biogenezę AMPAR i wskazują na ich wyraźny wpływ na przekaźnictwo synaptyczne i funkcje mózgu.

Author(s): Brechet, Aline, PhD, Reis, Prof. Andre, PhD, MD, Sticht, Prof. Heinrich, PhD, Al-Sannaa, Nouriya, Rolfs, Prof. Arndt, MD, Kulik, Akos, PhD, Schulte, Uwe, PhD, Colleaux, Laurence, PhD, Jamra, Rami Abou, MD, Nitschke, Patrick, Bole-Feysot, Christine, PhD, Buchert, Rebecca, Schwenk, Jochen, PhD, Boudkkazi, Sami, PhD, Zolles, Gerd, PhD, Siquier-Pernet, Karine, Schaber, Irene, Bildl, Wolfgang, PhD, Saadi, Abdelkrim, Fakler, prof. Bernd, MD
Read publication (PDF)

Nowa homozygotyczna mutacja PCK1

U wszystkich osób dotkniętych tą chorobą wykryto nową, homozygotyczną mutację PCK1 w tym badaniu. Przeprowadzono sekwencjonowanie całego eksomu. Czytaj więcej!

Zebrano dane kliniczne i laboratoryjne od trzech fińskich pacjentów, w tym od pary rodzeństwa i innego niespokrewnionego dziecka z niewyjaśnioną hipoglikemią w dzieciństwie. W analizie kwasów organicznych w moczu stwierdzono przejściowe podwyższenie poziomu transaminazy alaninowej, mleczanów i metabolitów cyklu kwasów trikarboksylowych, zwłaszcza fumaranu. U pacjentów i ich rodziców przeprowadzono sekwencjonowanie eksomu. U wszystkich chorych wykryto nową homozygotyczną mutację PCK1 c.925GNA (p.G309R).

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Vieira, Päivi, Cameron, Jessie, PhD, Rahikkala, Elisa, PhD, MD, Zhang, Lin-Hua, PhD, Santra, Saikat, Matthews, Allison, PhD, Myllynen, Päivi, PhD, MD, Nuutinen, Matti, PhD, MD, Moilanen, Jukka, PhD, MD, Rodenburg, Richard, PhD, Uusimaa, Johanna, PhD, MD, van Karnebeek, Clara DM, PhD, MD
Read publication (PDF)

Zbiór danych wspierający generację typu Niemanna-Picka C1

Dane przedstawione w tym artykule przedstawiają generację i charakterystykę dwóch nowych, specyficznych dla pacjenta, indukowanych linii komórek macierzystych pluripotentnych NPC1. Czytaj więcej!

Dane przedstawione w niniejszym artykule przedstawiają generację i charakterystykę dwóch nowych, specyficznych dla pacjenta linii indukowanych pluripotentnych komórek macierzystych (iPSC) z chorobą Niemanna-Picka typu C1 (NPC1). Do reprogramowania wykorzystano fibroblasty z nową homozygotyczną mutacją c.1180T>C oraz dominującą homozygotyczną mutacją c.3182T>C. Reprogramowanie w specyficzne dla pacjenta komórki iPSC zostało indukowane poprzez retrowirusową transdukcję czynników transkrypcyjnych Sox2, Klf4, Oct4 i c-Myc, a następnie potwierdzone na podstawie ich pluripotentności.

Author(s): Rolfs, prof. Arndt, MD, Frech, Moritz J, PhD, Peter, Franziska, Trilck, Michaela, PhD, Rabenstein, Michael
Read publication (PDF)