Publicações científicas

Descoberto um novo gene causador de doença

A descoberta de novas doenças genéticas depende cada vez mais de grandes bancos de dados e de esforços colaborativos internacionais. A CENTOGENE orgulha-se de participar de inúmeras iniciativas de pesquisa relevantes. Um projeto recente nessa área identificou mutações no gene PIGB como causadoras de uma nova síndrome neurometabólica. O estudo resultante, que envolveu grupos de dez países, foi publicado no prestigiado periódico American Journal of Human Genetics.

A descoberta de novas doenças genéticas depende cada vez mais de grandes bancos de dados e de esforços colaborativos internacionais. A CENTOGENE orgulha-se de participar de inúmeras iniciativas de pesquisa relevantes. Um projeto recente nessa área identificou mutações no gene PIGB como causadoras de uma nova síndrome neurometabólica. O estudo resultante, que envolveu grupos de dez países, foi publicado no prestigiado periódico American Journal of Human Genetics.

Otimização do rendimento diagnóstico

O conhecimento genético sobre doenças hereditárias raras está aumentando rapidamente. Pacientes que receberam um laudo diagnóstico negativo podem, portanto, se beneficiar de uma reanálise de seus exomas ou genomas. Um estudo recente, iniciado pelo projeto CENTOGENE, forneceu evidências impressionantes para essa hipótese. Em um grupo de pacientes com distúrbios do neurodesenvolvimento, para os quais nenhum diagnóstico pôde ser estabelecido antes de 2017, a reanálise revelou diversas variantes potencialmente causadoras em genes de doenças descritos posteriormente. Essas descobertas foram publicadas na edição de junho do Journal of Neurodevelopmental Disorders.

O conhecimento genético sobre doenças hereditárias raras está aumentando rapidamente. Pacientes que receberam um laudo diagnóstico negativo podem, portanto, se beneficiar de uma reanálise de seus exomas ou genomas. Um estudo recente, iniciado pelo projeto CENTOGENE, forneceu evidências impressionantes para essa hipótese. Em um grupo de pacientes com distúrbios do neurodesenvolvimento, para os quais nenhum diagnóstico pôde ser estabelecido antes de 2017, a reanálise revelou diversas variantes potencialmente causadoras em genes de doenças descritos posteriormente. Essas descobertas foram publicadas na edição de junho do Journal of Neurodevelopmental Disorders.

Variantes bialélicas no fator de transcrição PAX7 são uma nova causa genética de miopatia.

A maioria dos novos genes causadores de doenças está sendo identificada atualmente em populações consanguíneas menos estudadas. Graças ao seu posicionamento global, a CENTOGENE tem contribuído significativamente para esses projetos de pesquisa. O exemplo mais recente é a descoberta de mutações recessivas no fator de transcrição PAX7, responsáveis por uma nova forma de doença muscular. Os resultados foram publicados na Genetics in Medicine, uma das principais revistas científicas da área.

A expressividade da doença varia amplamente em muitas doenças genéticas, e a identificação dos fatores modificadores subjacentes possui grande potencial translacional. Graças aos seus recursos em termos de tecnologias e amostras, o projeto CENTOGENE está em uma posição única para contribuir significativamente com esforços relevantes. Um exemplo recente revelou um novo fator modificador da gravidade da doença e da disfunção cognitiva na distonia-parkinsonismo ligada ao cromossomo X. Os resultados foram publicados no prestigiado periódico Annals of Neurology.

Uma variante homozigótica de alteração da estrutura de leitura em um éxon com splicing alternativo do gene DLG5 causa hidrocefalia e displasia renal.

Com o objetivo de proporcionar o máximo rendimento diagnóstico, o projeto CENTOGENE oferece acompanhamento de resultados negativos de sequenciamento de exoma completo (WES) e sequenciamento de genoma completo (WGS) em um contexto de pesquisa. Recentemente, essa abordagem resultou na associação de uma forma especial de hidrocefalia congênita com a inativação bialélica do gene DLG5. A descoberta, que representa a definição de uma nova doença rara, foi publicada na revista Clinical Genetics em versão antecipada, em 21 de fevereiro.

Utilidade e implicações do sequenciamento do exoma na doença de Parkinson de início precoce.

Embora a carga genética seja alta na doença de Parkinson de início precoce, a investigação completa do rendimento diagnóstico genético ainda não foi estabelecida. Os objetivos deste estudo foram avaliar variantes em genes conhecidos para DP e outros distúrbios do movimento e encontrar novos candidatos em 50 pacientes com DP de início precoce.

Desenvolvimento de um algoritmo baseado em evidências que otimiza a sensibilidade e a especificidade no diagnóstico baseado em ES de uma população de pacientes clinicamente heterogênea.

A sensibilidade e a especificidade das abordagens de NGS não estão bem definidas, mas podem ser estimadas pela aplicação paralela de NGS e sequenciamento de Sanger. Utilizando essa estratégia, buscamos otimizar o diagnóstico baseado em sequenciamento de exoma (ES) em uma população de pacientes clinicamente diversa.

O sequenciamento de nova geração (NGS) está substituindo rapidamente o sequenciamento de Sanger no diagnóstico genético. A sensibilidade e a especificidade das abordagens de NGS não estão bem definidas, mas podem ser estimadas pela aplicação paralela de NGS e sequenciamento de Sanger. Utilizando essa estratégia, buscamos otimizar o diagnóstico baseado em sequenciamento de exoma (ES) em uma população de pacientes clinicamente diversa.

Algoritmo baseado em evidências no diagnóstico baseado em ES

Otimização de diagnósticos baseados em sequenciamento de exoma (ES). O sequenciamento de nova geração (NGS) está substituindo rapidamente o sequenciamento de Sanger em diagnósticos genéticos. A sensibilidade e a especificidade das abordagens de NGS não estão bem definidas, mas podem ser estimadas pela aplicação paralela de NGS e sequenciamento de Sanger.

O sequenciamento de nova geração (NGS) está substituindo rapidamente o sequenciamento de Sanger no diagnóstico genético. A sensibilidade e a especificidade das abordagens de NGS não estão bem definidas, mas podem ser estimadas pela aplicação paralela de NGS e sequenciamento de Sanger. Utilizando essa estratégia, buscamos otimizar o diagnóstico baseado em sequenciamento de exoma (ES) em uma população de pacientes clinicamente diversa.

A primeira variante patogênica de sentido trocado no gene KAT6A

A CENTOGENE publicou os resultados de mais um estudo colaborativo bem-sucedido no prestigiado periódico Journal of Human Genetics, intitulado: “Uma variante KAT6A em uma família com microcefalia e atraso no desenvolvimento de herança autossômica dominante”.”

A CENTOGENE publicou os resultados de mais um estudo colaborativo bem-sucedido no prestigiado periódico Journal of Human Genetics, intitulado: “Uma variante KAT6A em uma família com microcefalia e atraso no desenvolvimento de herança autossômica dominante”.”

Necessidades não atendidas na interpretação de variantes genômicas humanas

A qualidade e a precisão de um diagnóstico final não se resumem apenas à correta classificação das variantes e à interpretação clínica. O diagnóstico começa no nível pré-analítico, e toda interpretação subsequente pode produzir um efeito negativo ou positivo.

A qualidade e a precisão de um diagnóstico final não consistem apenas na classificação correta das variantes e na interpretação clínica. O diagnóstico começa no nível pré-analítico, e toda a interpretação subsequente pode produzir um efeito negativo ou positivo, dependendo da qualidade da preparação laboratorial.

Nova mutação homozigótica no gene PCK1

Uma nova mutação homozigótica no gene PCK1 foi detectada em todos os indivíduos afetados neste estudo. O sequenciamento completo do exoma foi realizado. Leia mais!

Dados clínicos e laboratoriais foram coletados de três pacientes finlandeses, incluindo um par de irmãos e uma criança não relacionada com hipoglicemia infantil inexplicada. Elevação transitória de alanina aminotransferase, lactato e intermediários do ciclo do ácido tricarboxílico, especialmente fumarato, foi observada na análise de ácidos orgânicos na urina. O sequenciamento do exoma foi realizado para os pacientes e seus pais. Uma nova mutação homozigótica PCK1 c.925GNA (p.G309R) foi detectada em todos os indivíduos afetados.

Novas mutações no gene GNB1 interrompem a montagem e a função dos heterotrímeros da proteína G e causam atraso global no desenvolvimento em humanos.

Utilizando o sequenciamento do exoma, identificamos 14 novas variantes diferentes no gene GNB1 em 16 pacientes pediátricos. Leia mais em nossos artigos científicos mais recentes!

O atraso global do desenvolvimento (AGD), frequentemente acompanhado de deficiência intelectual, convulsões e outras características, é um distúrbio grave, clinicamente e geneticamente muito heterogêneo, com início na infância. Nos casos em que as causas genéticas foram identificadas, mutações de novo em genes expressos neuronalmente são um cenário comum. Essas mutações podem ser melhor identificadas pelo sequenciamento do exoma de trios pais-filhos. Mutações de novo no gene da proteína de ligação a nucleotídeos de guanina beta 1 (GNB1), que codifica a subunidade Gβ1 das proteínas G heterotriméricas, foram recentemente identificadas como uma nova causa genética de AGD.

Sequenciamento Clínico do Exoma – Resultados de 2819 Amostras Representando 1000 Famílias

Um estudo foi conduzido utilizando o sequenciamento de exoma completo (WES) para identificar variantes patogênicas subjacentes, ou variantes provavelmente patogênicas, em 1.000 casos de diagnóstico de 54 países diferentes. Leia mais!

Um estudo foi conduzido utilizando sequenciamento de exoma completo (WES) para identificar variantes patogênicas subjacentes, ou variantes provavelmente patogênicas, em 1.000 casos diagnósticos de 54 países diferentes. Os pacientes selecionados apresentaram uma ampla variedade no número, natureza e gravidade dos sintomas. As informações clínicas fornecidas pelos médicos solicitantes foram traduzidas para termos HPO e o WES foi realizado em amostras dos pacientes de acordo com configurações padronizadas.

Diretrizes para o sequenciamento diagnóstico de nova geração

Apresentamos aqui diretrizes para a avaliação e validação de aplicações de sequenciamento de nova geração para o diagnóstico de doenças genéticas. Leia mais!

O trabalho foi realizado por um grupo de geneticistas de laboratório e bioinformáticos, e discutido com geneticistas clínicos, representantes da indústria e de pacientes, e outras partes interessadas na área da genética humana. As declarações redigidas durante a elaboração das diretrizes são apresentadas aqui.

Nova mutação missense no gene GNB1 em um paciente com distonia generalizada, hipotonia e deficiência intelectual.

O sequenciamento do exoma de uma menina alemã de 15 anos e de seus pais, que não apresentavam a doença, revelou uma mutação de novo heterozigótica no gene GNB1. Leia mais!

Recentemente, o sequenciamento do exoma ampliou nosso conhecimento sobre as causas genéticas do atraso no desenvolvimento por meio da identificação de mutações de novo na linhagem germinativa da proteína de ligação a nucleotídeos de guanina beta 1 (GNB1) em 13 pacientes com deficiência neurodesenvolvimental e uma ampla gama de sintomas e sinais adicionais, incluindo hipotonia em 11 pacientes e convulsões em 10. Distonia de membro/braço foi encontrada em 2 pacientes.

Sequenciamento completo do exoma em uma doença rara: um paciente com anomalia da artéria coronária esquerda originando-se da artéria pulmonar (síndrome de Bland-White-Garland)

Apresentamos os resultados do primeiro sequenciamento completo do exoma (WES) de um paciente com ALCAPA que está em acompanhamento há 8 anos. Leia mais!

A origem anômala da artéria coronária esquerda a partir da artéria pulmonar (ALCAPA), também conhecida como síndrome de Bland-White-Garland, é uma anomalia congênita rara, com incidência de 1 em 300.000 nascidos vivos. Neste artigo, relatamos os resultados do primeiro sequenciamento completo do exoma (WES) de um paciente com ALCAPA que foi acompanhado por 8 anos; seu curso clínico foi descrito anteriormente em outro estudo (Türkmen et al., 2014).