O Sequenciamento de Exoma Completo (WES, na sigla em inglês) é um teste genético abrangente que identifica alterações no DNA de um paciente que são causadoras ou relacionadas aos seus problemas de saúde. Ao focar em todas as regiões codificadoras de proteínas do genoma – o exoma – o WES oferece a cobertura necessária para diagnosticar pacientes de forma rápida e confiável.
Superando os obstáculos do diagnóstico de doenças raras e neurodegenerativas com CentoXome
Com mais de 7.000 doenças raras identificadas e aproximadamente 801 TP4T associadas a causas genéticas, o diagnóstico de pacientes com doenças raras pode ser frequentemente difícil, resultando em jornadas diagnósticas longas, caras e emocionalmente desgastantes.1,2
Com o sequenciamento de exoma completo (WES), isso não precisa ser assim. Contendo a maioria (~85%) das alterações causadoras de doenças conhecidas, o WES revela a causa de doenças raras em menos tempo e a um custo geral menor, resultando em melhores desfechos para os pacientes. Com o CentoXome, elevamos o WES a um novo patamar. Aprimorado para fornecer cobertura clínica e poder diagnóstico incomparáveis em um único teste, nosso produto e interpretação médica utilizam o maior repositório de dados do mundo real para doenças raras e neurodegenerativas: o Biobanco CENTOGENE.
Tecnologia de ponta desenvolvida por especialistas em testes multiômicos para doenças raras e neurodegenerativas, combinada com excelente cobertura clínica e poder diagnóstico incomparável em um único teste.
Informações de ponta, impulsionadas pelo pipeline de bioinformática CE-IVD da CENTOGENE e pelo Biobanco de Dados da CENTOGENE.
Apoio vitalício por uma equipe dedicada a melhorar a vida de pacientes com doenças raras.
O design e o serviço CentoXome oferecem qualidade e desempenho ideais, provenientes do líder mundial e parceiro de confiança no diagnóstico de doenças raras e neurodegenerativas, com excelente cobertura clínica e poder diagnóstico clínico incomparável em um único teste. Combinando informações do Biobanco CENTOGENE para doenças raras e neurodegenerativas com tecnologia ômica superior, você se beneficia de uma solução que oferece um rendimento diagnóstico maior em comparação com o sequenciamento de exoma completo (WES) padrão.3–12
| Principais características e desempenho | |
|---|---|
| Ampla e uniforme cobertura do exoma e do genoma mitocondrial | Cobertura altamente uniforme de todo o exoma (~ 20.000 genes), limites éxon-íntron de +/- 10 pb e genoma mitocondrial completo (37 genes) ≥ 98 regiões-alvo de % cobertas em ≥ 20x |
| Cobertura ampliada de regiões clinicamente relevantes. | Cobertura ampliada de genes associados a doenças ( OMIM® , HGMD® , CENTOGENE Biodatabank), com ≥ 99 regiões-alvo de % cobertas em ≥ 20x. Cobertura de variantes clinicamente relevantes conhecidas em regiões codificadoras e não codificadoras ( HGMD® , ClinVar, CENTOGENE Biodatabank). |
| Detecção de variantes avançada e sensível | Detecção de SNVs, InDels, SVs, incluindo CNVs com alterações desde o nível do éxon até o nível citogenômico, e mtDNA com heteroplasmia ≥ 15 %SensitivitySNVs e InDels (≤ 50 bp)> 99,6 %CNVs*A especificidade de > 99,9% para % é garantida para todas as variantes relatadas.**detecção UPD*** para as regiões cromossômicas clinicamente relevantes bem conhecidas: 6q24, 7, 11p15.5, 14q32, 15q11q13, 20q13 e 20 |
SNVs: variantes de nucleotídeo único; InDels: pequenas inserções/deleções; CNVs: variações no número de cópias; ATUALIZAÇÃO: dissomia uniparental; mtDNA: DNA mitocondrial.
* A sensibilidade do software de detecção de CNV é superior a 95% (%); no entanto, essa sensibilidade pode ser reduzida para regiões repetitivas e homólogas, como pseudogenes, bem como para eventos que abrangem dois ou menos exons.
** As variantes de baixa qualidade e/ou zigozidade incerta são confirmadas por métodos ortogonais: SNVs e InDels por sequenciamento de Sanger; CNVs por amplificação de sonda dependente de ligação multiplex (MPLA), reação em cadeia da polimerase quantitativa (qPCR) ou microarranjo cromossômico (CMA).
*** O rastreio de UPD é realizado utilizando um algoritmo interno para Erros de Herança Mendeliana (EIM) para detetar regiões de homozigosidade (ROH) nas regiões cromossómicas clinicamente relevantes mais conhecidas. Garantimos testes confirmatórios internos através de CMA quando necessário.
O CentoXome oferece uma solução rápida e econômica para o diagnóstico de doenças raras e neurodegenerativas, servindo como teste de primeira e segunda linha para identificar diagnósticos moleculares em pacientes com suspeita de distúrbios genéticos ou resultados negativos em testes genéticos anteriores.3, 5, 11 Além disso, pode fornecer uma alternativa economicamente viável a múltiplos ensaios moleculares independentes, simplificando assim o processo de diagnóstico.
Tradicionalmente, o sequenciamento de exoma completo (WES) tem sido recomendado quando os pacientes apresentam fenótipos complexos e heterogêneos sugestivos de múltiplas condições ou quando testes genéticos anteriores foram inconclusivos. Sua utilização na prática clínica aumentou significativamente nos últimos anos, superando testes genéticos padrão, como genes individuais, painéis de sequenciamento de nova geração (NGS) e análise de microarranjos cromossômicos.4, 10, 13–15 Além disso, há evidências crescentes do valor econômico do uso do sequenciamento de genoma completo (WGS) ou do exoma completo (WES) como teste de primeira linha.16–18 As diretrizes do ACMG (American College of Medical Genetics and Genomics) e de outras sociedades médicas recomendam o sequenciamento de exoma/genoma como um teste diagnóstico de primeira ou segunda linha quando os sintomas do paciente ou o histórico familiar sugerem uma causa genética para a doença.19–22 Além disso, os resultados dos testes de WES podem levar a diagnósticos mais rápidos, melhor prevenção de doenças sintomáticas, tratamentos mais direcionados ou até mesmo eliminar a necessidade de alguns procedimentos caros ou invasivos.10 ,14, 15, 19, 23
Recomendamos especialmente o CentoXome para pacientes quando:
Oferecemos opções flexíveis de testes e serviços adicionais para fornecer uma análise CentoXome personalizada às necessidades do seu paciente, como, por exemplo, o sequenciamento de exoma completo (WES) para gestações em andamento com anomalias fetais para diagnóstico pré-natal (CentoXome Pré-natal), e nossas soluções multiômicas de WES (CentoXome MOx 1.0 e 2.0) integram diferentes conjuntos de dados, servindo como ferramentas altamente eficazes para o diagnóstico precoce de doenças raras e neurodegenerativas.
Comprometida em melhorar a vida de pacientes com doenças raras e neurodegenerativas, a CentoXome oferece suporte diagnóstico vitalício por meio de um programa de reclassificação proativo e gratuito, além de uma reanálise acessível em nível de caso para resultados incertos ou negativos. O rendimento diagnóstico do sequenciamento de exoma completo (WES) está em constante crescimento devido à rápida descoberta de novas associações entre genes e doenças, e estima-se que cerca de 10 a 201 pacientes com a mutação TP4T possam ser diagnosticados por meio da reclassificação e da reanálise de dados genômicos.15, 24
| Opções e serviços adicionais | |||
|---|---|---|---|
| Teste de projeto* | A análise do genoma mitocondrial Solo, Duo, Trio e PLUSMitochondrial é realizada apenas para o paciente índice e amostras maternas. | ||
| Soluções de teste | CentoXome | Sequenciamento de exoma completo (WES) para testes diagnósticos pós-natais de doenças raras e neurodegenerativas. Prazo de entrega: ≤ 30 dias úteis. | |
| CentoXome MOx** | Soluções multiômicas de teste único que integram WES com testes bioquímicos e/ou RNA-seq para variantes de splicing. CentoXome MOx 1.0 e 2.0 para testes pós-natais de doenças raras e neurodegenerativas. Tempo de resposta do CentoXome MOx 1.0: ≤ 30 dias úteis. Tempo de resposta do CentoXome MOx 2.0: ≤ 35 dias úteis. | ||
| CentoXome Pré-natal*** | Sequenciamento de exoma completo (WES) para diagnóstico pré-natal (gravidez em curso) quando anomalias estruturais do feto são detectadas por ultrassom ou quando o diagnóstico não pode ser obtido por métodos pré-natais de rotina. Testes prioritários e acelerados, incluindo cultura celular e análise de contaminação por células maternas (MCC). Prazo de entrega: ≤ 15 dias úteis. | ||
| CentoXome POC*** | Sequenciamento de exoma completo (WES) para diagnóstico do produto da concepção (perda gestacional) em casos de óbito fetal intrauterino ou natimorto, visando melhor compreender a causa da perda fetal e o risco de recorrência, ou quando o diagnóstico não pode ser obtido por métodos de rotina. Inclui cultura celular e análise de MCC. Prazo de entrega: ≤ 30 dias úteis. | ||
| Variantes CentoXome | Dados brutos e processados do WES (arquivos nos formatos FASTQ, BAM e VCF, juntamente com arquivos de variantes filtrados e anotados no formato XLS) disponíveis para pesquisas adicionais. Download gratuito via CentoPortal por um período de 30 dias. Prazo de entrega: ≤ 20 dias úteis. | ||
| Opções adicionais | Processamento RÁPIDO | ≤ 15 dias úteis (não aplicável com CentoXome MOx 2.0) | |
| Dados brutos gratuitos | Para todas as soluções de teste acompanhadas de relatórios médicos, estão disponíveis como opções tanto os dados brutos quanto os processados. Esses dados incluem arquivos nos formatos FASTQ, BAM e VCF, bem como um arquivo de variantes filtrado e anotado no formato XLS. Esses dados podem ser baixados gratuitamente pelo CentoPortal por um período de 30 dias. | ||
| Suporte diagnóstico vitalício**** | Reclassificação proativa em nível de variante; relatório de reclassificação emitido sem custo adicional. Reanálise em nível de caso para resultados incertos/negativos (por exemplo, novas informações clínicas, intervalos de um ano) a um custo acessível. | ||
TAT: Tempo de resposta
* Solo: apenas o paciente índice afetado é testado; Duo: o paciente índice e um membro da família, afetado ou não, são testados; Trio: o paciente índice e dois membros da família, afetados ou não, são testados; PLUS: um membro adicional da família além do Trio é testado.
**Mais detalhes sobre nossas Soluções Multiômicas .**
*** A análise do genoma mitocondrial baseada em WES e o rastreio de UPD não são oferecidos devido a limitações técnicas. Mais detalhes sobre Testes Pré-natais .
**** A reanálise de casos está disponível apenas para pedidos com dados de sequenciamento originais a partir de agosto de 2020. Mais detalhes sobre o Programa de Reclassificação de Variantes .
Ao escolher nosso serviço de sequenciamento de exoma completo (WES), médicos, pacientes e parceiros podem ter a certeza de que receberão sequenciamento de alta qualidade, combinado com a melhor análise e interpretação de dados, documentadas em relatórios médicos abrangentes. Ao combinar dados fenotípicos detalhados com dados genotípicos usando nosso pipeline de bioinformática CE-IVD, a CENTOGENE identifica com precisão as variantes causadoras de doenças para fornecer relatórios clínicos de excelência.
A CentoXome sempre inclui relatórios médicos baseados em nossa experiência em interpretação clínica, dados de variantes selecionados de alta qualidade do nosso Biobanco de Dados e diretrizes internacionais de melhores práticas. Uma equipe de geneticistas clínicos e cientistas altamente treinados interpreta os dados e verifica cada relatório médico. Todas as classificações históricas de alta qualidade são selecionadas e codificadas em nosso Biobanco de Dados, que serve como referência para decisões diagnósticas e classificações.
Os relatórios de exames sempre contêm resultados clínicos claros e acionáveis, recomendações e opções de acompanhamento. São orientados pelo fenótipo e focados em relatar achados relacionados à apresentação clínica do paciente/indicações do paciente.
Para obter mais informações, consulte a página da Web sobre Relatórios Médicos .
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Evidências clínicas e genéticas adicionais da disfunção do complexo ASC-1 em doenças neuromusculares congênitas.
O splicing alternativo do gene BUD13 determina a gravidade de uma doença do desenvolvimento com lipodistrofia e características progeroides.
Nossa rede global de suporte ao cliente e especialistas o guiará em cada etapa do processo.
Envie-nos uma mensagemApoio Regional1Fatos RAROS – Genes Globais; 2Genética e Doenças Raras (GARD) do NIH; 3Cheema et al. 2020, PMID: 33083013; 4Clark et al. 2018, PMID: 30002876; 5Dados arquivados na CENTOGENE; 6Gross et al. 2018, PMID: 30293986; 7Posey et al. 2019, PMID: 31234920; 8Schon et al. 2020, PMID: 32674947; 9Scuffins et al. 2021, PMID: 33495530;10Stark et al. 2016, PMID: 26938784;11Trujillano et al. 2017, PMID: 27848944;12Wagner et al. 2019, PMID: 31059585; 13Srivastava et al. 2019, PMID: 31182824; 14 Smith. et al.2019, PMID: 29760485; 15 Vissers et al. 2017, PMID: 28333917; 16 Bowling et al. 2017, PMID: 28554332; 17 Malinowski et al. 2020, PMID: 32203227; 18 Trosman et al. 2020, PMID: 31501586); 19 Manickham et al. 2021, PMID: 34211152; 20 Matthijs et al. 2016, PMID: 2762856; 21 Souche et al. 2022, PMID: 35577938; 22 Boicote et al. 2015, PMID: 25951830); 23 Liu et al. 2019, PMID: 31216405; 24 Wright et al. 2018, PMID: 29323667; 25Recurso de Genômica Clínica. www.clinicalgenome.org; 26 Miller et al. 2021, PMID: 34012069; 27 Richards et al. 2015, PMID: 25741868.
