1 de fevereiro de 2019
A CENTOGENE, empresa especializada em doenças raras e comprometida em melhorar a vida de pacientes com essas doenças, fornecendo soluções que aceleram o desenvolvimento de medicamentos, publicou o desenvolvimento de uma estrutura racional para otimizar a sensibilidade e a especificidade no diagnóstico baseado em sequenciamento de exoma completo (WES) em uma população de pacientes clinicamente heterogênea, utilizando validação por sequenciamento Sanger ortogonal.
Embora o sequenciamento de nova geração (NGS) esteja claramente substituindo o método de sequenciamento de DNA de Sanger não apenas para pesquisa, mas também para testes de diagnóstico genético de rotina, estudos têm demonstrado que ele não é tão confiável quanto um teste genético isolado. Como o NGS introduz um número relevante de falsos positivos e falsos negativos, a CENTOGENE determinou como otimizar o uso do sequenciamento de Sanger ortogonal de variantes em paralelo ao analisar casos limítrofes. Na edição de janeiro de 2019 da revista Genetics in Medicine, a CENTOGENE descreveu, no artigo intitulado "Desenvolvimento de um algoritmo baseado em evidências que otimiza a sensibilidade e a especificidade no diagnóstico baseado em sequenciamento de exoma (ES) de uma população de pacientes clinicamente heterogênea", uma estrutura na qual as variantes identificadas pelo NGS podem ser avaliadas e monitoradas de forma consistente, reduzindo significativamente a necessidade dessa validação adicional.
A CENTOGENE desenvolveu uma árvore de decisão que considera três características específicas das variantes: pontuação de qualidade, número de leituras e frequência. Ao utilizar esse preditor, é possível classificar 91,71% das variantes com especificidade de 100% e sensibilidade de 99,8%, restando apenas 8,31% das variantes para confirmação por sequenciamento Sanger adicional. Esse resultado evita a subnotificação e a supernotificação, possibilitando diagnósticos mais precisos para pacientes com doenças raras que, de outra forma, não seriam detectadas. As implicações desse aumento na especificidade e na sensibilidade também se traduzem em capacidades de monitoramento mais consistentes.
“A nova estrutura que desenvolvemos para otimizar a sensibilidade e a especificidade em diagnósticos baseados em sequenciamento de exoma completo (WES) reforça o foco estratégico da CENTOGENE: transformar dados clínicos e genéticos para impulsionar o diagnóstico médico rápido de doenças hereditárias”, disse o Professor Peter Bauer, MD, Diretor Científico da CENTOGENE e principal autor do estudo. “Essa estrutura pode ser otimizada em toda a indústria, academia e clínica sem comprometer a precisão do diagnóstico genético.”
O estudo foi realizado em uma ampla população de pacientes do mundo real e incorpora dados de aproximadamente 1.000 variantes genômicas candidatas. As amostras dos pacientes foram fornecidas como sangue com EDTA ou como manchas de sangue seco em cartões de filtro usando o CentoCard® da CENTOGENE — uma solução logística global desenvolvida pela CENTOGENE para simplificar a coleta de amostras em todo o mundo.
