即使对于经验最丰富的医生来说，快速可靠地诊断罕见病和神经退行性疾病也并非易事。然而，随着科技的进步，全基因组测序（WGS）作为一线诊断手段的应用，以及我们对遗传因素认识的不断加深，这一挑战如今比以往任何时候都更容易应对。.
CENTOGENE 的增强型全基因组测序 (WGS) 解决方案 CentoGenome 是全球最全面的罕见病和神经退行性疾病诊断工具之一，可在单次检测中提供无与伦比的基因组覆盖率和诊断能力。这一尖端解决方案结合了由精简的 CE-IVD 生物信息学流程驱动的卓越技术和基于医学专家的解读。 CENTOGENE生物数据库. CentoGenome 可以在一次测试中检测出几乎所有变异类型，从序列变异到更复杂的变异，如拷贝数变异、单亲二体和重复扩增。.
CentoGenome 通过实施无聚合酶链式反应 (PCR) 技术，显著降低了偏差，并为难以测序的基因区域提供了高质量的序列信息，从而能够更深入地了解编码区、调控区和内含子区。.
作为世界领先企业和值得信赖的合作伙伴，CENTOGENE 提供免费且主动的诊断确认和必要的变异重新分类服务。.
CentoGenome 利用我们 CE-IVD 生物信息学流程和医学专家解读的先进数据分析，并借助 CENTOGENE 生物数据库，提供卓越的变异检测。.
CentoGenome 的所有优势和品质，只需 5 个工作日即可体验。
作为一线检测手段，CentoGenome是目前市场上最全面的商业化全基因组测序（WGS）检测之一，可检测罕见病和神经退行性疾病——单次检测即可涵盖几乎所有致病变异，包括大多数已知的与神经系统疾病相关的重复序列扩增。1. CentoGenome还能检测与脊髓性肌萎缩症（SMA）相关的拷贝数变异（CNV），以及与戈谢病（GD）和易感性相关的致病变异。 GBA1与帕金森病 (PD) 相关的帕金森病，具有最高的敏感性。.
新设计的全基因组测序（WGS）检测方法采用了一种无需PCR的策略。这显著降低了PCR通常引入的偏差，并通过实现更均匀的覆盖度和更优异的变异检测性能，在基因组中通常具有挑战性的区域提供更高质量的序列数据。.
| 主要特性及性能 | |
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| 均匀基因组覆盖率 |
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| 高级且灵敏的变异检测 |
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| 增强变异体检测 与SMA和GD/PD相关*** |
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SNV单核苷酸变异；; 插入缺失： 小幅插入/删除；; SVs： 结构变异；; CNV： 拷贝编号变体；; 更新： 单亲二体；; 线粒体DNA： 线粒体DNA
* 低质量和/或合子性不明确的变异体通过正交方法进行确认：SNV 和 InDel 通过 Sanger 测序进行确认；CNV 通过多重连接依赖性探针扩增 (MLPA)、定量聚合酶链式反应 (qPCR) 或染色体微阵列 (CMA) 进行确认。对于与重复序列扩增疾病、单亲二体 (UPD) 相关的已报告变异体，必要时也会采用正交方法进行内部确认性检测。, SMN1/SMN2 CNV 和转换事件 GBA1 和 GBAP1, 分别采用片段长度分析（FLA）、CMA、MLPA 和 qPCR 方法进行检测。
**我们使用内部开发的孟德尔遗传错误（MIE）算法对单亲二体（UPD）进行筛查，以检测已知的具有临床意义的染色体区域的纯合性片段（ROH）。重复序列扩增的筛查则由ExpansionHunter程序完成。.
*** SMA筛查采用SMN Caller算法进行检测 SMN1/SMN2 CNV。. GBA1 使用高斯算法进行筛选，以检测影响包含外显子 9-11 (NM_000157.3) 区域的重组事件，该区域与具有最高同源性的区域 GBAP1
CentoGenome是诊断罕见病和神经退行性疾病的理想解决方案。它可作为一线检测手段，用于疑似遗传疾病患者的分子诊断；也可作为二线检测手段，用于既往基因检测结果为阴性的患者。与进行多项独立的分子检测相比，CentoGenome提供了一种更具成本效益的分子诊断替代方案。.
近期研究以及医学遗传学会关于临床全基因组测序（WGS）的声明和建议支持将其作为一线或二线诊断检测手段，尤其适用于患者症状或家族史提示疾病遗传病因的情况。 <sup>2-6 </sup> 当临床诊断与高度遗传异质性相关，且WGS能够带来显著的临床改善和/或更具成本效益时，更应如此。例如，美国医学遗传学与基因组学学会（ACMG）建议将外显子组/基因组测序作为智力障碍、发育迟缓或多发性先天性异常儿童的一线检测手段。<sup> 5</sup>我们特别推荐以下情况下的患者使用CentoGenome：
这些症状非常广泛、复杂或不典型，无法指向特定疾病或典型表型，例如：
先前的检测未能提供明确的诊断结果，例如：
快速诊断是医疗上的必要条件，但并非总有时间进行一系列的检测，例如：
在我们的一项 WGS 研究中，我们在迄今为止最大的患者队列之一的临床环境中进行了 WGS，证明了 WGS 作为最全面的基因检测的诊断能力，以及它与 WES 相比的优势。.7 结果还支持将全基因组测序视为‘护理标准‘用于基因检测，以及作为罕见病患者的一线独立检测方法。.
我们提供灵活的检测方案和增值服务，以满足您患者的特定需求。我们的服务包括针对胎儿异常妊娠的全基因组测序 (WGS)（CentoGenome Prenatal），以及整合不同数据集以获取最完整临床信息的尖端多组学 WGS 解决方案（CentoGenome MOx 1.0 和 2.0）。更多详情，请参见下表。.
快速诊断对于及时有效的医疗干预至关重要。近期多项研究表明，全基因组测序（WGS）的高诊断率和短周转时间能够改善新生儿重症监护室（NICU）和儿科重症监护室（PICU）中危重症新生儿和儿童的临床决策。.8-14 CentoGenome 超快速检测，仅需 5 天即可完成。, 作为一种全面、准确的工具，当用作诊断危重症新生儿或儿童的一线检测方法时，可能会改善关键决策。.
我们提供灵活的检测方案和根据患者需求量身定制的附加服务，并通过免费的重新分类计划提供终身诊断支持，以及价格合理的病例级重新分析。.
| 选项和附加服务 | |||
|---|---|---|---|
| 测试设计* | Solo、Duo、Trio 和 PLUS 线粒体基因组分析仅针对先证者及其母亲样本进行。 | ||
| 测试解决方案 | |||
| CentoGenome | 用于罕见病和神经退行性疾病产后诊断检测的全基因组测序（WGS）周转时间：≤ 20 个工作日 | ||
| CentoGenome MOx** | 将全基因组测序 (WGS) 与生化检测和/或 RNA 测序 (RNA-seq) 相结合的多组学单次检测解决方案，用于剪接变异检测。CentoGenome MOx 1.0 和 2.0 用于罕见病和神经退行性疾病的产后检测。CentoGenome MOx 1.0 的检测周期：≤ 20 个工作日；CentoGenome MOx 2.0 的检测周期：≤ 35 个工作日。 | ||
| CentoGenome 产前检查*** | 当超声检查发现胎儿结构异常或常规产前方法无法确诊时，可进行全基因组测序（WGS）以进行产前诊断（妊娠中）。该检测可加快速度并优先处理，包括细胞培养和母体细胞污染（MCC）分析。周转时间：≤ 15 个工作日 | ||
| CentoGenome 概念验证*** | 全基因组测序 (WGS) 用于诊断宫内胎儿死亡或死产的妊娠产物（妊娠丢失），以更好地了解胎儿丢失的原因和复发风险，或在常规方法无法获得诊断时使用。包括细胞培养和 MCC 分析。周转时间：≤ 20 个工作日 | ||
| CentoGenome 变异 | WGS原始数据和处理后的数据（FASTQ、BAM和VCF格式的文件，以及XLS格式的过滤和注释后的变异文件）可供进一步研究，可通过CentoPortal免费下载，有效期为30天。处理时间：≤ 20个工作日。 | ||
| CentoGenome 超快速 | 处理时间：≤ 5 个工作日 | ||
| 其他选项 | |||
| 快速处理 | ≤ 15 个工作日（不适用于 CentoGenome MOx 2.0） | ||
| 免费原始数据 | 所有附带医疗报告的检测方案均提供原始数据和处理后的数据两种选择。这些数据包括 FASTQ、BAM 和 VCF 格式的文件，以及经过筛选和注释的 XLS 格式变异文件。这些数据可通过 CentoPortal 免费下载，有效期为 30 天。 | ||
| 终身诊断支持**** | 主动进行变异体级别的重新分类；免费提供重新分类报告；针对不确定/阴性结果（例如，新的临床信息、一年间隔）进行病例级别的重新分析，费用合理。 | ||
TAT：周转时间；周转时间从样品在 CENTOGENE Rostock 实验室登记之时开始，到报告上传至 CentoPortal 之时结束。
*单人检测：仅对受感染的指标患者进行检测；双人检测：对指标患者及其受感染或未受感染的家庭成员进行检测；三人检测：对指标患者及其两名受感染或未受感染的家庭成员进行检测；附加检测：在三人检测的基础上，再增加一名家庭成员进行检测。
**更多关于我们多组学解决方案的详细信息。
*** 由于技术限制，我们目前不提供基于全基因组测序（WGS）的线粒体基因组分析以及单亲二体（UPD）、重复序列扩增、 SMN1 / SMN2拷贝数变异（CNV）和GBA1基因转换的筛查。更多产前检测详情，请参阅相关资料。
**** 病例重新分析仅适用于 2020 年 8 月及之后提交的包含原始测序数据的订单。更多详情请参阅变异重分类计划。.
从数百万个基因变异中精准定位致病变异极具挑战性。全新 CentoGenome 利用我们分析全球数万例患者基因组/外显子组的经验，帮助您诊断疑似患有遗传性疾病的患者。.
选择我们的全基因组测序 (WGS) 服务，医生、患者和合作伙伴可以信赖我们提供的高质量测序服务。我们采用最先进的无 PCR 测序技术，并结合全自动 CE-IVD 生物信息学流程进行高级数据分析。随后，我们经验丰富的临床遗传学家和科学家团队将对数据进行细致解读，并对每份医疗报告进行交叉核对。必要时，我们会采用正交方法进行免费的内部验证性检测，并利用 CENTOGENE 生物数据库来确认结果并验证变异的致病性，从而确保提供一流的医疗报告。.
检测报告始终包含清晰、可操作的临床结果、建议和后续方案。它们以表型为导向，侧重于报告与患者临床表现/适应症相关的检测结果。.
更多信息，请参阅医疗报告网页。 .
BUD13基因的选择性剪接决定了一种伴有脂肪营养不良和早衰特征的发育障碍的严重程度。
1 CENTOGENE 数据库存档数据； 2 Boycott 等，2015 年，PMID：25951830； 3中华医学会医学遗传分会，2019 年，PMID：31216797； 4 Manickam 等，2021 年，PMID：34211152； 5 Sachdev 等，2021 年，PMID：33566436； 6 Souche 等，2022 年，PMID：35577938； 7 Bertoli-Avella 等，2020 年，PMID：32860008； 8 Kingsmore 等，2019 年，PMID：31564432； 9 Petrikin 等，2018 年，PMID：29449963； 10索登等人。 2014年；电话号码：25473036； 11范迪门等人。 2017年，PMID：28939701； 12威利格等人。 2015年，PMID：25937001； 13耶兹科娃等人。 2022年，PMID：36086948 ； 14桑德斯等人。 2012年，PMID：23035047； 15临床基因组资源。 https://www.clinicalgenome.org/ ； 16米勒等人。 2021年，PMID：34012069； 17理查兹等人。 2015年，PMID：25741868
