利用 CentoXome® 识别具有临床意义的内含子变异
在所附案例研究中，我们先进的全外显子组测序解决方案 CentoXome 成功确诊了一名 14 岁女孩的疑难杂症——尽管该病例复杂，且其他实验室的分析均告失败。CENTOGENE 通过检测已知的致病性、具有临床意义的内含子变异，为这位女孩及其家人带来了希望。.
全外显子组测序 (WES) 是一种全面的基因检测，可以识别患者 DNA 中与疾病相关的致病或致病改变。WES 通过检测基因组中所有编码蛋白质的区域（即外显子组），为您提供快速可靠诊断患者所需的全面信息。.
利用 CentoXome 克服罕见病和神经退行性疾病诊断的障碍
目前已发现 7000 多种罕见病，其中约 801 种与遗传原因有关，因此诊断罕见病患者往往很困难，导致漫长、昂贵且令人情绪崩溃的诊断过程。.1,2
有了全外显子组测序 (WES)，情况就完全不同了。WES 包含了绝大多数（约 851 个 TP4T）已知的致病突变，能够以更短的时间和更低的总体成本揭示罕见病的病因，从而改善患者的治疗效果。CentoXome 将 WES 提升到了新的高度。我们的产品设计和医学解读均基于全球最大的罕见病和神经退行性疾病真实世界数据存储库——CENTOGENE 生物数据库，旨在通过单次检测提供无与伦比的临床覆盖范围和诊断能力。
由多组学检测领域专家提供的先进技术，可用于罕见病和神经退行性疾病的检测，并结合卓越的临床覆盖范围和无与伦比的诊断能力，所有检测均可在一次测试中获得。
借助 CENTOGENE 的 CE-IVD 生物信息学流程和 CENTOGENE 生物数据库，获取一流的洞察。
由一支致力于改善罕见病患者生活的团队提供终身支持
CentoXome 的设计和服务由全球领先的罕见病和神经退行性疾病诊断专家和值得信赖的合作伙伴提供，品质卓越，性能优异，在单次检测中即可实现出色的临床覆盖率和无与伦比的临床诊断能力。结合 CENTOGENE 罕见病和神经退行性疾病生物数据库的洞见以及卓越的组学技术，该解决方案相比标准 WES 具有更高的诊断率。.3–12
| 主要特性及性能 | |
|---|---|
| 广泛且均匀的外显子组和线粒体基因组覆盖 | 整个外显子组（约20,000个基因）、±10 bp外显子-内含子边界以及完整的线粒体基因组（37个基因）均得到高度均匀的覆盖，≥98个%靶区域的覆盖度≥20倍。 |
| 加强对临床相关区域的覆盖 | 增强了疾病相关基因（ OMIM® 、 HGMD® 、CENTOGENE 生物数据库）的覆盖度，≥ 99 个 % 靶区覆盖度≥ 20 倍；增强了编码区和非编码区已知临床相关变异的覆盖度（ HGMD® 、ClinVar、CENTOGENE 生物数据库）。 |
| 高级且灵敏的变异检测 | 检测单核苷酸变异 (SNV)、插入缺失 (InDel)、结构变异 (SV)，包括从外显子水平到细胞基因组水平的拷贝数变异 (CNV)，以及具有异质性的线粒体DNA (mtDNA) ≥ 15 % 灵敏度 SNV 和插入缺失 (InDel) (≤ 50 bp) > 99.6 % CNV*> 95.0 %特异性 > 99.9 %对所有已报告的变异体均有保证**UPD检测*** 针对以下已知的具有临床意义的染色体区域：6q24、7、11p15.5、14q32、15q11q13、20q13 和 20 |
SNV： 单核苷酸变异；; 插入缺失： 小幅插入/删除；; CNV： 拷贝编号变体；; 更新单亲二体；; 线粒体DNA： 线粒体DNA。.
* CNV 检测软件灵敏度 > 95 %；但是，对于重复和同源区域（如假基因）以及跨越两个或更少外显子的事件，这种灵敏度可能会降低。.
** 质量低下和/或合子性不明确的变异通过正交方法进行确认：SNV 和 InDel 通过 Sanger 测序进行确认；CNV 通过多重连接依赖性探针扩增 (MPLA)、定量聚合酶链式反应 (qPCR) 或染色体微阵列 (CMA) 进行确认。.
*** 采用内部开发的孟德尔遗传错误（MIE）算法进行单亲二体（UPD）筛查，以检测已知的临床相关染色体区域的纯合性片段（ROH）。必要时，保证使用染色体微阵列分析（CMA）进行内部确认检测。.
CentoXome 为诊断罕见病和神经退行性疾病提供了一种快速且经济高效的解决方案，可作为一线和二线检测方法，用于识别疑似遗传疾病或先前基因检测结果为阴性的患者的分子诊断。.3, 5, 11 此外，它还可以提供一种经济有效的替代方案，取代多种独立的分子检测，从而简化诊断过程。.
传统上，当患者表现出复杂、异质性的表型，提示可能患有多种疾病，或既往基因检测结果不明确时，建议进行全外显子组测序（WES）。近年来，WES在临床实践中的应用显著增加，超过了单基因检测、二代测序（NGS）panel和染色体微阵列分析等标准基因检测方法。.4、10、13-15 此外，越来越多的证据表明，使用 WGS/WES 作为一线检测方法具有经济价值。.16–18 美国医学遗传学和基因组学学会 (ACMG) 和其他医学协会的指南建议，当患者的症状或家族史表明疾病是由遗传原因引起时，应将外显子组/基因组测序作为一线或二线诊断测试。.19-22 此外，WES 的检测结果可能有助于更快地诊断疾病、更好地预防有症状的疾病、更有针对性的治疗，甚至可以避免一些昂贵或有创的手术。.10 ,14, 15, 19, 23
我们特别推荐 CentoXome 用于以下患者：
我们提供灵活的检测选项和附加服务，以提供根据您的患者需求量身定制的 CentoXome 分析，例如，针对胎儿异常的持续妊娠进行 WES 以进行产前诊断（CentoXome Prenatal），以及我们的多组学 WES 解决方案（CentoXome MOx 1.0 和 2.0），整合了不同的数据集，是早期诊断罕见病和神经退行性疾病的高效工具。.
CentoXome致力于改善罕见病和神经退行性疾病患者的生活，提供终身诊断支持，包括免费且积极的重新分类计划，以及在结果不确定或阴性时提供价格合理的个案级重新分析。由于新基因疾病发现的快速发展，全外显子组测序（WES）的诊断率持续提高，据估计，通过重新分类和基因组数据重新分析，每年可确诊约10-201例未确诊患者。.15, 24
| 选项和附加服务 | |||
|---|---|---|---|
| 测试设计* | Solo、Duo、Trio 和 PLUS 线粒体基因组分析仅针对先证者及其母亲样本进行。 | ||
| 测试解决方案 | CentoXome | 用于罕见病和神经退行性疾病产后诊断检测的全外显子组测序 (WES) 周转时间：≤ 30 个工作日 | |
| CentoXome MOx** | CentoXome MOx 1.0 和 2.0 是一款多组学单次检测解决方案，整合了全外显子组测序 (WES)、生化检测和/或 RNA 测序，用于检测剪接变异。该方案适用于罕见病和神经退行性疾病的产后检测。CentoXome MOx 1.0 的检测周期：≤ 30 个工作日；CentoXome MOx 2.0 的检测周期：≤ 35 个工作日。 | ||
| CentoXome 产前*** | 当超声检查发现胎儿结构异常，或常规产前方法无法确诊时，可进行全外显子组测序（WES）用于产前诊断（妊娠中）。该检测提供快速优先处理，包括细胞培养和母体细胞污染（MCC）分析。周转时间：≤ 15 个工作日 | ||
| CentoXome 概念验证*** | 全外显子组测序 (WES) 用于诊断性检测妊娠产物（妊娠丢失），适用于宫内胎儿死亡或死产的情况，以更好地了解胎儿丢失的原因和复发风险，或在常规方法无法获得诊断时使用。包括细胞培养和 MCC 分析。周转时间：≤ 30 个工作日 | ||
| CentoXome 变异 | WES原始数据和处理后的数据（FASTQ、BAM和VCF格式的文件，以及XLS格式的过滤和注释后的变异文件）可供进一步研究，可通过CentoPortal免费下载，有效期为30天。处理时间：≤ 20个工作日。 | ||
| 其他选项 | 快速处理 | ≤ 15 个工作日（不适用于 CentoXome MOx 2.0） | |
| 免费原始数据 | 所有附带医疗报告的检测方案均提供原始数据和处理后的数据两种选择。这些数据包括 FASTQ、BAM 和 VCF 格式的文件，以及经过筛选和注释的 XLS 格式变异文件。这些数据可通过 CentoPortal 免费下载，有效期为 30 天。 | ||
| 终身诊断支持**** | 主动进行变异体级别的重新分类；免费提供重新分类报告；针对不确定/阴性结果（例如，新的临床信息、一年间隔）进行病例级别的重新分析，费用合理。 | ||
TAT：周转时间
*单人检测：仅对受影响的指标患者进行检测；双人检测：对指标患者和受影响或未受影响的家庭成员进行检测；三人检测：对指标患者和两名家庭成员（受影响或未受影响）进行检测； PLUS 检测：在三人检测的基础上，再对一名家庭成员进行检测。
**更多关于我们多组学解决方案的详细信息。
*** 由于技术限制，我们目前不提供基于全外显子组测序（WES）的线粒体基因组分析和单亲二体（UPD）筛查。更多产前检测详情，敬请关注。
**** 病例重新分析仅适用于 2020 年 8 月及之后提交的包含原始测序数据的订单。更多详情请参阅变异重分类计划。
选择我们的全外显子组测序 (WES) 服务，医生、患者和合作伙伴可以放心，他们将获得高质量的测序结果，以及一流的数据分析和解读，所有信息都将记录在全面的医疗报告中。CENTOGENE 利用我们获得 CE-IVD 认证的生物信息学流程，将深度表型数据与基因型数据相结合，从而精准识别致病变异，提供一流的临床报告。.
CentoXome始终提供基于我们临床解读专长的医学报告、来自我们生物数据库中一流的精选变异数据以及国际最佳实践指南。一支训练有素的临床遗传学家和科学家团队负责解读数据并交叉核对每份医学报告。所有历史高质量分类均已整理并编码到我们的生物数据库中，该数据库是诊断决策和分类的参考依据。.
检测报告始终包含清晰、可操作的临床结果、建议和后续方案。它们以表型为导向，侧重于报告与患者临床表现/适应症相关的检测结果。.
更多信息，请参阅医疗报告网页。 .
BUD13基因的选择性剪接决定了一种伴有脂肪营养不良和早衰特征的发育障碍的严重程度。
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