高品質的醫學報告是建立值得信賴合作夥伴關係的關鍵。
在 CENTOGENE，我們始終以患者為核心，這一理念充分體現在我們的患者導向醫學報告中。從檢測到報告完成的每一個環節，皆設有嚴謹的品質控管機制，以確保資料分析與醫學判讀的準確性與可靠性。
我們將臨床資訊與基因型－表現型（Genotype–Phenotype）分析結果整合，並於報告中的「結果判讀（Interpretation）」章節及圖示（Pictogram）中，以精簡易懂的方式呈現，協助臨床醫師快速掌握檢測結果與其臨床意義。基因變異分類流程由 CENTOGENE 的臨床科學專家依循 American College of Medical Genetics and Genomics（ACMG）及 Clinical Genome Resource（ClinGen）所建議的國際標準，透過嚴謹且全面的分析流程完成判讀。此外，CENTOGENE 生物資料庫目前已收錄超過 100 萬名來自120 多個國家的個體資料，其中超過 70% 為非歐洲族群，並涵蓋大量兒科病例，為基因變異分類與臨床判讀提供強大的數據支持。報告亦提供詳細的基因變異與疾病說明，以及依據個案量身制定的臨床建議，協助醫師進行疾病診斷，並為患者及其家屬提供更完善的醫療指引。同時，每項檢測皆附有透明且完整的方法學說明與檢測限制，確保報告內容清楚、完整且符合臨床需求。
在 CENTOGENE，我們將基因變異分類視為遺傳疾病診斷過程中的關鍵環節。 自 ACMG 於 2015 年首次發布基因變異分類指引以來，相關方法持續由 ClinGen 進一步完善與發展。CENTOGENE 一直走在業界前端，率先將最新的國際指引與建議整合至醫學報告流程中，涵蓋單核苷酸變異（SNVs）及拷貝數變異（CNVs）的分類與判讀。 為進一步提升基因變異分類的準確性，我們亦整合 CENTOGENE 生物資料庫（Biodatabank） 的洞察與分析成果。此專有變異資料庫收錄詳細的臨床資訊、基因變異發生頻率及地理來源等資料，為基因變異判讀提供更全面且可靠的科學依據，協助提升診斷準確性與臨床決策品質。
我們持續系統性地重新評估新發現的基因變異，並將所有新的分類結果免費通知相關醫療專業人員，作為我們對全球罕見疾病及神經退化性疾病患者的終身承諾，協助患者持續受益於最新的科學發現與醫學進展。
針對所有 次世代定序（Next-Generation Sequencing, NGS）基因檢測套組 依循 American College of Medical Genetics and Genomics／AMP 基因變異分類指引，並結合 Clinical Genome Resource 的建議，將序列變異（Sequence Variants）分為五個等級：致病（Pathogenic）、可能致病（Likely Pathogenic） 、意義未明變異（Variant of Uncertain Significance, VUS）、可能良性（Likely Benign）、良性（Benign）。針對拷貝數變異（Copy Number Variants, CNVs），則依循 ACMG／ClinGen 的 CNV 分類指引，同樣分為上述五個等級。此外，我們亦可辨識其他具有臨床意義的基因變異，例如疾病風險因子（Risk Factors）及修飾變異（Modifier Variants）等。在基因變異分類過程中，除了參考公開資料庫外，我們亦整合 CENTOGENE 生物資料庫（Biodatabank） 的專有資料，進一步提升變異判讀的準確性與可靠性。
在分析流程的最後階段，所有已識別的基因變異及其相關註釋（Annotations），皆會進一步評估其與患者臨床症狀及／或臨床疑似診斷之間的關聯性，以判斷其臨床意義，並納入最終醫學報告。
全外顯子定序（WES）針對人類基因體中蛋白質編碼區（外顯子，Exome）進行分析，涵蓋約 1% 的基因體序列，其中亦包含目前尚未證實與人類疾病相關的基因。針對檢測到的基因變異，我們依循前述的基因變異分類流程，整合公開資料庫與多項專業資源進行判讀，包括：Online Mendelian Inheritance in Man（OMIM）與 HGMD®，各基因專屬資料庫、PubMed 科學文獻與基因型－表現型資料庫（如 CENTOGENE 生物資料庫）。
依據國際指引及臨床診斷情境，報告僅納入已確認與人類疾病具有明確關聯之基因中的變異。對於與患者臨床表現相關的基因變異，皆會納入最終醫學報告，並結合患者提供的臨床資訊，評估其致病性。此外，醫學報告亦會綜合患者的臨床表現及家族病史，提供適當的後續診斷建議。對於已證實與特定疾病表型具有臨床意義的疾病相關多型性（Disease-associated Polymorphisms），亦會一併納入報告。
全基因體定序（WGS）是目前最全面的基因體分析方法，可分析整個基因體，避免目標富集（Target Enrichment）所造成的偏差及定序覆蓋率不足等限制。WGS 可同時分析：單核苷酸變異（SNVs）、拷貝數變異（CNVs）、插入／缺失變異（INDELs）、結構變異（SVs）。除涵蓋約 1% 的蛋白質編碼區外，亦可分析約 99% 的非編碼區序列，因此能提供更完整的基因體資訊。WGS 的醫學判讀與報告流程與 WES 相同，皆依循國際指引，並由醫學與遺傳學專家進行綜合分析與判讀。
部分患者可能同時帶有兩項致病（Pathogenic）或可能致病（Likely Pathogenic）基因變異。這些變異可能：分別造成兩種不同且互不重疊的臨床疾病表現；或共同導致同一主要臨床表型。遇到此類情況時，在正式出具報告前，CENTOGENE 的醫學專家可能會與委託檢測的臨床醫師進一步討論，以確保檢測結果獲得最適切的臨床解讀。
若臨床醫師提出需求，我們亦可提供與患者目前疾病或症狀無直接關聯，但具有明確醫療處置意義（Medically Actionable）的基因變異資訊，即次要（偶發）發現（Secondary／Incidental Findings）。相關報告除列出檢測到的基因變異外，亦會提供目前可取得的治療或臨床管理資訊。依循 ACMG 指引，我們針對 73 個指定基因進行次要（偶發）發現的評估與報告。1,2 。
Miller, DT, Lee, K., Chung, WK. et al. ACMG SF v3.0 list for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing: a policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med (2021). doi.org/10.1038/s41436-021-01172-3
Miller, D.T., Lee, K., Gordon, A.S. et al. Recommendations for reporting of secondary findings in clinical exome and genome sequencing, 2021 update: a policy statement of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med (2021). doi.org/10.1038/s41436-021-01171-4
